自从我们更新到 R2.15.1 以来，我的 lyx 文档中由调用乳胶函数（包 Hmisc）产生的表在外部 xdvik 窗口中打开，而不是插入到我正在编译的 pdf 文档中。相反，使用 xtable 生成的表格和使用 ggplot 生成的图表确实出现在文档中它们所属的位置。

乳胶调用的块头是

然后该块被多次引用，例如

xdvik 窗口中的表格看起来确实很完美。有任何想法吗？

我正在用 knitr 用 R 写报告。我正在使用 xtable() 在报告中生成表格。我的一张表包括负数和正数。我想将负数的颜色更改为红色。我怎样才能做到这一点？显然，一个简单的解决方案是更改 xtable 生成的乳胶代码，但请注意，我有一个自动报告，数字可以随新数据集而改变，我不想手动设置颜色。

这是一个简单的代码：

如何使负数变为红色？感谢您的帮助。

我需要调用一个在 knitr 中的 R 块中的表名中有下划线的数据库。有几千个表名，更改名称会很麻烦。就像是：

由于“table_10_20”中的下划线，我收到了我缺少 $（“Missing $ inserted”）的错误。我已经玩了很多添加'\$ \'和'\$ \'，你的名字。还使用了 cat()、paste()、单引号和双引号。有什么建议么？在此先感谢您的帮助。我正在运行 Ubuntu 11.10，并使用 pdfLaTeX 从 RStudio 调用 knitr，如果这很重要的话。

使用时，pairs()我喜欢使用建议的函数panel.cor和panel.hist（在示例中建议）来消除重复的上三角空间或下三角空间并提供额外信息。

我想使用类似的东西来获取这些功能

并且没有得到任何输出（包括：）Error in readLines(file, warn = FALSE) : 'con' is not a connection，并且没有打印示例图。这可能吗？

正如我旁注的那样，我不想打印这些图的原因是我想在R Markdown 文件中使用它，而不必查看example(pairs)我的文档中的图。

编织到 HTML 时，我在 knitr 中的代码输出块中出现文本换行问题。

例如，如果我运行以下命令：

HTML 中的输出将包装表格，给出如下输出，其中第 12 列移动到其余列下方：

有没有一种方法可以调整输出块的宽度，这样我就可以有一个表格，其中行全部出现在一行上，就像这样？

谢谢！

我有一个相当简单的数据框

如果我通过运行一行将其写入 .csv 文件，则一切正常。

但是，当使用 knitr 生成 .pdf 时，我（当然）使用块。

在这种情况下，我收到一条错误消息。

尺寸太大。

错误消息是针对“写...”的行给出的

有什么线索吗？

在创建 Rmd 文件时，我包含了一个内部超链接：

然后进一步锚定

然后当我使用 Knit HTML（在 RStudio 中）时，一切正常，内部超链接工作正常，但我也得到了一个不需要的�

如何避免出现此错误？

恐怕回答会是：“Markdown 本来就是简单的，但它不会那样做”，但问它（几乎）永远不会有坏处。

在编写 R Markdown 文档时，我可以在浏览器中查看 HTML 文件，它看起来很棒。当我尝试在纸上或 PDF 上打印它时，会打印图中的颜色，但不会突出显示语法。有没有办法在打印时保持语法突出显示？

例子：

我在 RStudio 中按下“Knit HTML”按钮并在 Chrome 或 Safari 中打开 HTML，没有任何问题。如果我从浏览器中的 HTML 打印，所有语法突出显示都会丢失。

我正在尝试建立一个工作流程来回答 SO 问题，并使用我的答案和/问题进行格式化knitr。 render_markdown(strict = T )

最近我试图在一些代码上运行分析，profr并且由于 的​​实现knitr，分析获取了所有对evaluateetc 的调用，这些调用支持knitr

例如

不在针织品中

如果我在平原上奔跑R

使用 knitr + profr

使用 knitr + Rprof + profr::parse_rprof

parse_rprof由于环境问题无法运行

knitr + Rprof + summaryRprof

使用utils::summaryRprof 遗嘱阅读和总结

它似乎并没有真正描述运行的代码，只有knitr/evaluate细节。

问题和可能的解决方案

我目前的工作流程是在 knitr 之外运行分析，但我发现自动格式化（用 注释掉输出##）非常有用。

有没有人遇到过一个巧妙的解决方案，或者是否需要与包开发人员一起讨论？

我目前的想法是重写parse_rprof以将自身限制为高于第一次调用的调用force（不是默认级别 7）

profr 的示例重写

profr这是几乎有效的重写

然而，结果与普通的不一样R

Rstudio 版本 0.96.331 和 knitr 版本 0.8

我认为我的问题已经通过更新 RStudio 和库得到了解决......但是：

R 中的以下运行为我提供了 940 个唯一的 Table.ID 值。在 knitr 块中运行，我得到 228 个唯一值和以下警告：

“在输入连接上发现无效输入‘ http://www2.census.gov/acs2010_5yr/summaryfile/Sequence_Number_and_Table_Number_Lookup.txt ’

我不明白为什么这两种方法之间存在区别。