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我想更改KnitHTML.RStudio 0.96.331

我按照这篇文章中的说明进行操作。

首先，我从这里复制过去的原始 markdown.css 。作为测试，我将前几行更改为：

到红色背景

并将其保存mymd.css在我的工作目录中。然后我创建一个 style.R 文件，如下所示：

最后，我通过单击 source 来获取 style.R 文件，然后返回该.Rmd文件并将其编织为 HTML。我得到红色背景，但未编译数学，例如 $\alpha$

我正在成为可重复分析和 Sweave、Beamer 以及特别是 knitr 包的粉丝。

RStudio 允许一键编织和编织文档，但 RStudio 虽然易于安装，但相当不稳定，不具备 Eclipse 的 StatET 插件的成熟度和灵活性。大多数教程或列表服务器在询问有关 knitr 和 RMarkdown 的问题时倾向于参考 RStudio IDE，但是关于如何安装 Markdown 文件并将其转换为.Rmd使用 knitr 包的内容很少。Jeffrey Horner 在宣布 R 降价包时说：

“与 RStudio 合作创建的将 Markdown 文档转换为 HTML。它在其同类最佳的 IDE 中提供了完整的 R Markdown 功能集，但用户可以将 Markdown 集成到他们自己选择的工具链中。”

最后一句话是我一直无法弄清楚的。在其他地方，我看到有人建议使用 knitr 手动编织library(knitr); knit('myfile.Rmd')，但是，在尝试执行此操作时，我收到一个错误：

我能够My file.md使用以下方法将文件转换为 html：

但是，R 代码没有运行，我怀疑我需要先编织.Rmd文件。任何有关如何在 StatET 或 Rstudio 以外的地方编写 markdown 文件的帮助或指导将不胜感激。

我在 Windows 7 Professional 操作系统上使用 R 版本 2.15.1 (2012-06-22)。Eclipse 版本：3.8.0 和 StatET 3.0。

我是 latex 和 knitr 的新手，当我使用 echo=FALSE 时，R 块的输出存在问题。下面的 .Rnw 代码按预期工作，即输出有

但是更改块开口以从输出中消除代码块

<<bghist2_mas_rma, fig.height=4, fig.width=6, echo=FALSE>>=

不仅从输出中删除代码（好），而且还覆盖 par() 设置，使得两个图形（每个 2 x 3）在页面上相邻放置，第二个图形的大部分从边缘脱落。

除了简单地将代码留在输出中之外，我怎么能解决这个问题？

谢谢

乙

我有一系列ggplots 我想按如下所示排列并插入到通过knitr. 而不是一个非常小的肖像人物，我想把它旋转成横向，这样它就可以尽可能地填满页面。有任何想法吗？

在 Lyx 中使用 Knitr 使用 summary() 函数时出现错误。它前面的功能有效。

我通过在 Lyx 中插入 Tex 代码输入此代码。我刚刚测试我可以运行摘要（teengamb）但不能运行摘要（mdl）。两种代码都可以在 RStudio 中使用。

错误是“未定义的控制序列”，描述为“\end{verbatim} ...”

我试图在 Lyx 中安装 Knitr 包，但遇到以下错误。

“模块 knitr 需要一个在您的 Latex 安装中不可用的包或您尚未安装的转换器。Latex 输出可能是不可能的。包缺少 Knitr>latex。”

如果您能帮我解决这个问题，我将不胜感激。我检查了 Lyx 模块，但不知道该怎么做。我是 Lyx 和 Knitr 的新用户。

先感谢您

我正在使用 knitr 在 Mac OSX 10.8.1 上的 RStudio 中编织 .Rnw 文件。当我编译 PDF（使用 RStudio 中的按钮或 Cmd-Shift-i）时，会出现默认的 RStudio PDF 查看器，并且视图设置为“自动”。有没有办法可以将此视图设置为打开“页面适合”，例如？下面是一个小的工作 .Rnw 文件的内容。

谢谢，RTM

当我在 RStudio 中编写 R markdown 文件时Knit HTML，我的公式（使用 $..$ 内联或使用 $$..$$ 显示）可以正确显示。但是，当我将 .md 文件推送到 GitHub 时，这些公式无法显示。它们只显示 $..$ 和 $$..$$。有没有办法让 GitHub 知道如何解析乳胶公式？谢谢！

我正在使用 Rstudio & Knitr (Ubuntu 12-04) 在 Rmd (markdown) 中编写幻灯片。我生成了一些带有块选项的视频，这些视频fig.show='animate'可以通过 knitr 生成的 HTML 很好地看到。

然后我使用 pandoc 生成滑动的 HTML 代码，但随后视频不显示，并显示以下消息：

找不到支持的视频格式和 MIME 类型

有谁知道如何使这些视频与 slidy 配合使用？

是否可以使用 knitr 生成子图（带有相关的子标题）？这是一个最小的工作示例：

这会产生两个标记为图 1 和图 2 的图，并带有定义的标题（分别）。但我希望它们被标记为“图 1a”和“图 1b”，就像您可以使用 subcaption LaTeX 包一样。

我知道有一个 knitr 选项“fig.env”，但这并不能解决它（至少不使用，例如，“fig.env = 'subfigure'”）。这里有一篇关于 Sweave 的类似帖子，但解决方案是不优雅的 hack：http ://texblog.org/2011/12/01/sweave-subfig-controlling-figure-size-and-placement/