python - NetworkX：绘制大图？

Question

我有一个graphML代表多个 SQL 表（节点和边）之间关系的文件。

我正在使用 networkx 来解析文件并matplotlib绘制它。我遇到的问题是我的图表很大（大约 150 个节点）并且难以阅读。我在计算机图形/绘图方面没有任何经验，最终结果看起来很乱，有没有办法在不减少节点总数的情况下提高图形的可读性（例如另一个库，更大的图像......）？

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

        
input_graph = nx.read_graphml("graph.graphml")
    
to_remove = []
for node, data in input_graph.nodes(data=True):
    if data['zone'] != 'gold' or input_graph.degree(node) == 0: 
       to_remove.append(node)
    
input_graph.remove_nodes_from(to_remove)
nx.draw(input_graph, with_labels=True)
plt.show()

Answer 1

一些选项是：

• 缩短节点标签并使用颜色来区分节点的组/类别（例如，属于组 A 的节点用红色着色，属于 B 的节点用蓝色等）；

• 尝试布局：默认布局是spring 布局，但另一种布局可能会给您带来更少的混乱，例如圆形布局；

• 使用数据着色器的边缘捆绑。