我试图运行 ONT basecaller guppy。我之前已经多次运行此代码,没有任何问题。现在(重新启动后)它正在产生错误消息:
[guppy/error] main: CUDA error at /builds/ofan/ont_core_cpp/ont_core/common/cuda_common.cpp:203: CUDA_ERROR_COMPAT_NOT_SUPPORTED_ON_DEVICE [guppy/warning] main: An error occurred in the basecaller. Aborting.
这是一个兼容性问题,如果是,我该怎么做才能解决它?我正在使用 Ubuntu 18.04.4 LTS (GNU/Linux 5.4.0-72-generic x86_64) 和 Guppy Basecalling Software,(C) Oxford Nanopore Technologies, Limited。版本 4.0.14+8d3226e,客户端-服务器 API 版本 2.1.0
这是我的孔雀鱼代码:
guppy_basecaller -i fast5/pass -r --device cuda:0 -s hac_fastqs_demul -c /opt/ont/ont-guppy/data/dna_r9.4.1_450bps_hac.cfg --num_callers 4 --require_barcodes_both_ends --trim_barcodes --detect_mid_strand_barcodes --barcode_kits "EXP-PBC001"