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我有一个 130 万行的出版物数据集,对于每条记录,我想从具有 860 万行的第二个数据集中检索一个 paper_id。这个想法是使用两个表中的多个列在 dataset2 中查找 dataset1 的匹配项,如此功能性但简化的脚本所示:

library(fuzzyjoin); library(tidyverse)

dataset1 %>%
  stringdist_left_join(dataset2 %>% select(Title, Year, Publication_id, Paper_id), 
                       by = list(x = c("Title", "Year", "Publication_id"), 
                                 y = c("Title", "Year", "Publication_id"))
                       max_dist = 3, ignore_case = TRUE, distance_col = NULL)

我这里有两个问题。首先是只有“标题”具有需要模糊匹配的变体(拼写错误、缩写、特殊字符等),但代码接受所有三个使用字段的变体。这会增加可能匹配错误的数量,因为类似的标题出现在不同的年份和出版物中。

我认为可以解决第一个问题的解决方案是:

library(fuzzyjoin); library(tidyverse)

dataset1 %>%
  stringdist_left_join(dataset2 %>% 
                       select(Title2 = Title, Year2 = Year, Pub_id2 = Publication_id, Paper_id), 
                       by = list(x = c("Title", "Year", "Publication_id"), 
                                 y = c("Title2", "Year2", "Pub_id2"))
                       max_dist = 3, ignore_case = TRUE, distance_col = NULL) %>%
  filter(Year == Year2, Publication_id == Pub_id2)

这将解决第一个问题,但还有第二个问题:脚本在样本数据上运行正常,但是当我尝试将它用于整个数据集时,它会给出错误“向量内存已用尽(达到限制?)”。

所以,我的问题是:

  1. 是否可以确定哪些列应该是相同的,哪些应该是模糊的,这可能会使脚本更轻?

  2. 是否有可能根据相同的变量对两个数据集进行子集化,然后在子集中的标题上运行模糊匹配,将所有内容合并回来?(我不确定这是否可行,因为我将拥有 18 万个子集:六年的 3 万份出版物)。

任何帮助表示赞赏。

最好的

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