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在处理非常大的数据帧时,我很难利用 Dask 分区。想象一个包含出租车行程日志的 200GB csv。我像这样加载数据:

df = dd.read_csv("/data/taxi_data_big.tsv", sep="\t")

然后对于每个司机,我想找出最早到机场的行程(DestinationId == 7)。

df1 = df[(df.DestinationId == 7)][["Date", "DriverId", "TripiId", "TripId_Rank", "DestinationId"]]

df1 数据框看起来像:

2020-01-01    D1    T1    8    7
2020-01-01    D1    T2    11   7
2020-01-01    D1    T3    44   7
2020-01-02    D1    T4    8    7
2020-01-02    D1    T5    13   7
2020-01-01    D2    T77   20   7
2020-01-01    D2    T177  76   7

2020 年 1 月 1 日,D2 司机第 20 次和第 76 次前往机场。

对于我的分析,我需要找到司机在去机场之前的平均行程次数。

df2 = df1.groupby('TripId').TripId_Rank.idxmin()会给我 TripId 和第一次去机场的索引。

df4 = df2.loc[df3]选择匹配的行。这适用于小数据集,但是当我移动到大数据集时,我得到了"ValueError: Not all divisions are known, can't align partitions" when performing math on dataframe column.

如果我的理解是正确的,则错误是由于数据帧被加载到多个分区中引起的,并且 Dask 文档要求在数据帧上设置显式索引。

df1 = df[(df.DestinationId == 7)][["Date", "DriverId", "TripiId", "TripId_Rank", "DestinationId"]].compute()

df1['id'] = np.arange(len(df2)) # explicitly add index column to the dataframe
df1 = df1.set_index("id") # is this really necessary? This takes hours to complete

df2 = df1.groupby('TripId').TripId_Rank.idxmin()
df4 = df2.loc[df3]
df

上面的代码有效,但我想知道这个问题是否有更好的解决方案。将 id 列添加到数据帧真的很慢,我不确定上面的代码是否利用了 Dask 并行化。

提前致谢。

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一种可能有效的方法是对分组数据使用应用。

df1 = df[(df.DestinationId == 7)][["Date", "DriverId", "TripiId", "TripId_Rank", "DestinationId"]]

df2['idx'] = df2.index

def foo(grouped_df):
    row_with_min_cnt_index = grouped_df['Impression_Rank'].idxmin()
    row_with_min_cnt = grouped_df.loc[row_with_min_cnt_index]
    return row_with_min_cnt['idx']

keep_ids = df2.groupby('DriverId').apply(foo, meta=('x', 'f8')).compute()
df2[df2['idx'].isin(keep_ids)].compute()

但是请注意,将“idx”列添加到现有数据框将需要很长时间。

于 2020-04-22T21:45:43.737 回答