使用 ggpubr 运行以下命令时,我收到错误
“f(...) 中的错误:只能处理在 x 轴上绘制的组的数据”
my_comparisons <- list( c('A_1538_C', '1594delete12') )
ggplot(dt) +
geom_jitter(width = 0.1, height = 0, aes(
x=reorder(allele,mu_normal),
y=mu_normal)) +
theme_bw() +
theme(axis.text.x = element_text(angle =60, vjust = 1, hjust=1)) +
stat_compare_means(comparisons = my_comparisons, method = "t.test")
stat_compare_means
在我的另一个情节中运行,当 x 是项的交互时,这不是其他人遇到的问题。(有关该问题的详细信息:https ://github.com/const-ae/ggsignif/issues/16 )
的价值
unique(dt$allele)
是
[1] A_1714_C C_1721_A G_1546_T A_443_T C_1535_T A_1538_C
[7] 1594delete12 rpoB_1547A.G rpoB_1534T.C WT rpsL_128A.G rpsL_263A.G
[13] gyrA_248C_T
15 Levels: 1594delete12 A_1538_C A_1714_C A_443_T blank C_1535_T ... rpsL_263A.G
所以看起来像是my_comparisons
一组现有的术语?(我想在它工作时进行更多比较)