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我熟悉linux中的split命令。如果我有一个 100 行长的文件,

split -l 5 myfile.txt

...将 myfile.txt 拆分为 20 个文件,每个文件有 5 行,并将它们写入文件。

我的问题是,我想按列执行此操作。给定一个有 100 列、制表符分隔的文件,是否有类似的命令可以将此文件拆分为 20 个较小的文件,每个文件有 5 列和所有行?

我知道如何使用 cut,但我希望有一个我从未听说过的简单 UNIX 命令可以在不使用 perl 或其他东西包装 cut 的情况下完成此操作。

提前致谢。

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7 回答 7

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#!/bin/bash

(($# == 2)) || { echo -e "\nUsage: $0 <file to split> <# columns in each split>\n\n"; exit; }

infile="$1"

inc=$2
ncol=$(awk 'NR==1{print NF}' "$infile")

((inc < ncol)) || { echo -e "\nSplit size >= number of columns\n\n"; exit; }

for((i=0, start=1, end=$inc; i < ncol/inc + 1; i++, start+=inc, end+=inc)); do
  cut -f$start-$end "$infile" > "${infile}.$i"
done
于 2011-03-10T21:14:08.227 回答
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如果您只需要一个 QAD(Quick & Dirty)解决方案,在我的情况下是一个固定的 8 列;分离的csv

#!/bin/bash
# delimiter is ;
cut -d';' -f1 "$1" > "${1}.1"
cut -d';' -f2 "$1" > "${1}.2"
cut -d';' -f3 "$1" > "${1}.3"
cut -d';' -f4 "$1" > "${1}.4"
cut -d';' -f5 "$1" > "${1}.5"
cut -d';' -f6 "$1" > "${1}.6"
cut -d';' -f7 "$1" > "${1}.7"
cut -d';' -f8 "$1" > "${1}.8"
于 2014-09-12T11:23:52.687 回答
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谢谢您的帮助。我希望会有一个类似于 split 的 unix 命令,但我最终通过 SiegeX 的建议用 perl 包装了 cut 命令。

#!/usr/bin/perl

chomp(my $pwd = `pwd`);
my $help = "\nUsage: $0 <file to split> <# columns in each split>\n\n";
die $help if @ARGV!=2;


$infile = $ARGV[0];
chomp($ncol = `head -n 1 $infile | wc -w`);

$start=1;
$inc = $ARGV[1];
$end = $start+$inc-1;

die "\nSplit size >= number of columns\n\n" if $inc>=$ncol;

for($i=1 ; $i<$ncol/$inc +1 ; $i++) {
    if ($end>$ncol) {$end=$ncol;}
    `cut -f $start-$end $infile > $infile.$i`;
    $start += $inc;
    $end += $inc;
}
于 2011-03-10T21:39:55.103 回答
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# do something smarter with output files (& clear on start)
XIFS="${IFS}"
IFS=$'\t'
while read -a LINE; do 
  for (( i=0; i< ${#LINE[@]}; i++ )); do
    echo "${LINE[$i]}" >> /tmp/outfile${i}
  done
done < infile
IFS="${XIFS}"

尝试上述...使用文件名'infile'

注意 IFS 的保存和恢复(有没有人有更好的主意?一个子shell?)

另请注意,如果您第二次运行,这会附加 - 您会想要删除先前运行的输出...

于 2011-03-10T21:30:03.243 回答
0

在这里你有我的解决方案:

首先是输入生成器:

    1 #!/usr/bin/env ruby                                                                                                                                                                                       
    2 #                                                                                                                                                                                                         
    3 def usage(e)                                                                                                                                                                                              
    4   puts "Usage #{__FILE__} <n_rows> <n_cols>"                                                                                                                                                              
    5   exit e                                                                                                                                                                                                  
    6 end                                                                                                                                                                                                       
    7                                                                                                                                                                                                           
    8 usage 1 unless ARGV.size == 2                                                                                                                                                                             
    9                                                                                                                                                                                                           
   10 rows, cols = ARGV.map{|e| e.to_i}                                                                                                                                                                         
   11 (1..rows).each do |l|                                                                                                                                                                                     
   12   (1..cols).each {|c| printf "%s ", c }                                                                                                                                                                   
   13   puts ""                                                                                                                                                                                                 
   14 end 

分割工具:

    1 #!/usr/bin/env ruby                                                                                                                                                                                       
    2 #                                                                                                                                                                                                         
    3                                                                                                                                                                                                           
    4 def usage(e)                                                                                                                                                                                              
    5   puts "Usage #{__FILE__} <column_start> <column_end>"                                                                                                                                                    
    6   exit e                                                                                                                                                                                                  
    7 end                                                                                                                                                                                                       
    8                                                                                                                                                                                                           
    9 usage 1 unless ARGV.size == 2                                                                                                                                                                             
   10                                                                                                                                                                                                           
   11 c_start, c_end = ARGV.map{|e| e.to_i}                                                                                                                                                                     
   12 i = 0                                                                                                                                                                                                     
   13 buffer = []                                                                                                                                                                                               
   14 $stdin.each_line do |l|                                                                                                                                                                                   
   15   i += 1                                                                                                                                                                                                  
   16   buffer << l.split[c_start..c_end].join(" ")                                                                                                                                                             
   17   $stderr.printf "\r%d", i if i % 100000 == 0                                                                                                                                                             
   18 end                                                                                                                                                                                                       
   19 $stderr.puts ""                                                                                                                                                                                           
   20 buffer.each {|l| puts l}

请注意,拆分工具将它正在处理的行数的值转储到 stderr,因此您可以了解运行速度有多快。

另外,我假设分隔符是一个空格。

如何运行它的示例:

 $ time ./gen.data.rb 1000 10 | ./split.rb 0 4 > ./out

生成 1000 行,每行 10 列,然后拆分前 5 列。我使用 time(1) 来测量运行时间。

我们可以使用一个小的 oneliner 来执行您要求的拆分(按顺序)。在单个节点中并行处理它(检查 bash 构建命令等待)或将它们发送到集群非常容易。

$ ruby -e '(0..103).each {|i| puts "cat input.txt | ./split.rb #{i-4} #{i} > out.#{i/4}" if i % 4 == 0 && i > 0}' | /bin/bash

基本上生成:

cat input.txt | ./split.rb 0 4 > out.1
cat input.txt | ./split.rb 4 8 > out.2
cat input.txt | ./split.rb 8 12 > out.3
cat input.txt | ./split.rb 12 16 > out.4
cat input.txt | ./split.rb 16 20 > out.5
cat input.txt | ./split.rb 20 24 > out.6
cat input.txt | ./split.rb 24 28 > out.7
cat input.txt | ./split.rb 28 32 > out.8
cat input.txt | ./split.rb 32 36 > out.9
cat input.txt | ./split.rb 36 40 > out.10
cat input.txt | ./split.rb 40 44 > out.11
cat input.txt | ./split.rb 44 48 > out.12
cat input.txt | ./split.rb 48 52 > out.13
cat input.txt | ./split.rb 52 56 > out.14
cat input.txt | ./split.rb 56 60 > out.15
cat input.txt | ./split.rb 60 64 > out.16
cat input.txt | ./split.rb 64 68 > out.17
cat input.txt | ./split.rb 68 72 > out.18
cat input.txt | ./split.rb 72 76 > out.19
cat input.txt | ./split.rb 76 80 > out.20
cat input.txt | ./split.rb 80 84 > out.21
cat input.txt | ./split.rb 84 88 > out.22
cat input.txt | ./split.rb 88 92 > out.23
cat input.txt | ./split.rb 92 96 > out.24
cat input.txt | ./split.rb 96 100 > out.25

并通过管道传输到 bash。

请注意您并行计算的进程(或作业)的数量,因为它会淹没您的存储(除非您有独立的存储卷)。

希望有帮助。让我们知道它为您运行的速度。

-drd

于 2011-03-11T05:02:29.963 回答
0

Split 实际上可以做你想做的事,只需要一点预处理

sed -E $'s/(([^\t]+\t){4}[^\t]+)\t/\\1\\n/g' myfile.txt | split -nr/20

这将写出 20 个带有x前缀的文件(在我的 split 版本中)。您可以验证这是否适用:

paste x* | cmp - myfile.txt

本质上,这是使用sed将每行拆分为 20 行,然后使用带有循环块的拆分将每行写入适当的文件。要使用不同的分隔符,请切换表达式中的制表符。数字 4 应该是每个文件的列数 - 1,拆分末尾的 20 是文件数。split 的附加参数可用于修改写入的文件名。此示例使用 bashes 转义扩展将制表符写入 sed 表达式和可以使用+运算符的 sed 版本,但如果您的系统上不存在这些效果,则可以通过其他方式实现这些效果。

我在 coreutils 邮件列表上从 Reuti 获得了这个解决方案的一个变体。

于 2017-01-25T23:02:17.220 回答
0

没有直接类似的东西会按列拆分您的文件。但是,您可以直接使用 AWK:

以下拆分包含列input_file的输出文件NUMBER

awk 'BEGIN{FS="\t"; m=NUMBER }
     { for(i=1;i<=NF;++i) { 
          s = (i%m==1 ? $i : s FS $i);                                                                                                                                                 
          if (i%m==0 || i==NF) {print s > (sprintf("out.%0.5d",int(i/m)+(i%m!=0)))}
     }}' input_file

输出文件input_file中的以下拆分CHUNKS

awk 'BEGIN{FS="\t"; n=CHUNKS}
     (NR==1){ m=int(NF/n)+(NF%n==0) }
     { for(i=1;i<=NF;++i) { 
          s = (i%m==1 ? $i : s FS $i);                                                                                                                                                 
          if (i%m==0 || i==NF) {print s > (sprintf("out.%0.5d",int(i/m)+(i%m!=0)))}
     }}' input_file
于 2018-07-23T16:16:38.987 回答