bioinformatics - vcftools - 在 MAC 上安装

Question

我正在尝试在 mac 上安装 vcftools。查看以前有关此问题的帖子，我确定我有 Mac OS X 开发人员工具（http://www.cnet.com/how-to/install-command-line-developer-tools-in-os-x /）。我遵循了官方文档（https://vcftools.github.io/examples.html）中推荐的程序。当我从命令行运行时：

./configure.ac

我收到以下错误：

./configure.ac：第 4 行：意外标记[2.63]' ./configure.ac: line 4:AC_PREREQ([2.63])'附近的语法错误

如果我尝试：

。/配置

它说：

-bash: ./configure: 没有这样的文件或目录

当我检查内容时，确实没有 ./configure ：

ls

谁能指出我做错了什么。我尝试过诸如“自制”之类的资源，但没有帮助。

非常感谢。

Answer 1

我遇到了同样的问题。基本上你需要安装automake。这可以使用

brew install automake

看看这个https://www.biostars.org/p/306802/

Answer 2

你可以从

git clone https://github.com/vcftools/vcftools.git
cd vcftools

您将需要安装 autoconf、pkg-config、libtools、automake 和 zlib。

跑

./autogen.sh

然后

./configure

按照此处的说明进行操作：https ://github.com/vcftools/vcftools