python - 使用 networkx 加权边缘列表时出错

Question

我创建了一个加权边列表，我试图用它来生成一个加权无向图：

数据在 csv 中，在 excel 中如下所示：

node1 node2 weight

a     b     0.1

a     c     0.3

正如其他 StackOverflow 帖子所推荐的那样，我一直在使用以下代码读取 csv：

fh=open("<file_location>.csv", 'r')
G = nx.read_weighted_edgelist(fh,delimiter=',')

第一行运行良好，但第二行产生错误消息：

TypeError: Failed to convert weight data weight to type type 'float'

如果我检查 G，它已经很好地读取了节点但没有读取权重，有什么想法吗？

score 4 · Accepted Answer

编辑：按照@Joel 的建议进行了重组，包括解释代码失败的原因以及如何解决。~~@Joel 的回答解释了代码失败的原因，但没有提出如何解决它的建议。~~

解决方案

nx.read_weighted_edgelist将忽略以开头的输入行#，因此如果您将 csv 文件的第一行从

node1 node2 weight

至

#node1 node2 weight

那么你应该能够在网络中读取权重。

另请注意，它read_weighted_edgelist接受文件路径（字符串）以及文件句柄，因此如果您不再使用fh，则无需先打开它，直接传递即可。

G = nx.read_weighted_edgelist("<file_location>.csv", delimiter=',')

（这是从@Joel 的回答中合并而来的）

当它遇到第一行时（来自您的评论a_node1,b_node2,c_weight：）

它将第一个节点解释为a_node1，第二个节点解释为b_node2，并尝试将权重分配给c_weight它们之间的边。

很难将字符串转换c_weight为浮点数。所以它给出了一个错误。

score 1 · Accepted Answer

当它遇到第一行时（来自您的评论a_node1,b_node2,c_weight：）

它将第一个节点解释为a_node1，第二个节点解释为b_node2，并尝试将权重分配给c_weight它们之间的边。

很难将字符串转换c_weight为浮点数。所以它给出了一个错误。