-1

我有两个数据集，一个有 884 个图像，另一个有 1057 个图像；数据集来自原位加热实验。我已经处理了数据（互相关、过滤等）。现在，我有两个二进制图像数据集。我需要测量每个图像中每个粒子的粒子数、面积和纵横比（我可以使用数字显微照片工具菜单中的粒子分析来完成）。我需要通过我的整个数据集连接测量值，这意味着，在一张图像中测量的一个粒子需要与另一张图像中的相同粒子。我相信这不是一项微不足道的任务。但是，有没有其他人知道我如何在这项任务中取得进展？

4

1 回答 1

1

以下信息可能对您的工作有用：

使用 命令在GMS 3中添加了对 DigitalMicrograph 的粒子分析功能的脚本访问FindParticles。

尚无文档，但以下脚本示例演示了该方法。

一些注意事项：

  • 掩码图像以及 foundParticlesImage 需要是二进制类型
  • 返回的图像文档包含作为电子表格的结果，菜单也返回一个

例子：

image inputImage := GetFrontImage()
number sx, sy
getsize( inputImage, sx, sy )

image mask := BinaryImage( "Binary Mask", sx, sy )      // The real input for analysis
Image foundParticlesImage := BinaryImage( "found", sx, sy ) // Accepted particles mask (result)

mask = inputImage>0.6*max(inputImage) ? 1 : 0           // This is a simple Treshold to test...

string mFields = "Area,FilledArea,CenterX"      // Specify analysis results
Number minParticleSize = 15                     // Limit accepted
Number doLabel = 0                              // Add labeled mask to inputImage True/False

imageDocument ResultsDoc = FindParticles(inputImage,mask,mFields, minParticleSize, doLabel, foundParticlesImage)
ImageDocumentShow( ResultsDoc )

Showimage( mask )
ShowImage( foundParticlesImage )

您可能还会发现以下有用：

自GMS 1以来，对二进制图像处理的脚本访问是 DigitalMicrograph 的一部分。这些命令反映了分析菜单选项：
MPOpen、MPClose、MPErode、MPDilate、MPOutline、MPDistanceMap、MPEuclideanDistanceMap、MPExactDistanceMap。

所有这些命令都要求掩码图像为二进制类型。

例子：

image CreateMPCloseStack( image maskInput, number neighbors, number iterations )
{
    number sx, sy
    GetSize( maskInput, sx, sy )
    image maskBinary := BinaryImage( "mask", sx, sy )
    maskBinary = maskInput
    image outStack := BinaryImage( "Stack", sx, sy, iterations + 1 )
    for( number n=0; n<= iterations; n++ )
    {
        outStack[0,0,n,sx,sy,n+1] = maskBinary
        maskBinary = MPClose( maskBinary, neighbors )
    }
    return outStack
}

image maskInput := GetFrontImage()
ShowImage( CreateMPCloseStack( maskInput, 5, 10 ) )
于 2016-11-10T11:12:21.317 回答