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我正在尝试计算多列的中值,但是我的数据有点古怪。它看起来像下面的例子。

library(data.table)

dt <- data.table("ID" = c(1,2,3,4),"none" = c(0,5,5,3), 
                 "ten" = c(3,2,5,4),"twenty" = c(0,2,3,1))


   ID none ten twenty
1:  1    0   3      0
2:  2    5   2      2
3:  3    5   5      3
4:  4    3   4      1

表中的 to 列表示该值的出现次数。我想计算出现的中位数。

例如对于 ID = 1

median(c(10, 10, 10))

是我想要创建的计算。

对于 ID = 2

median(c(0, 0, 0, 0, 0, 10, 10, 20, 20))

我已经尝试使用rep()并且lapply()成功非常有限,并且正在就如何实现这一目标进行一些明确的指导。我明白对于我这样的人来说,rep()我将不得不对我的值进行硬编码以重复(例如rep(0,2)or rep(10,2)),这就是我所期望的。我只是在努力创建一个包含每列重复的列表或向量。

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4 回答 4

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这是另一种data.table方式(假设 unique ID):

dt[, median(rep(c(0, 10, 20), c(none, ten, twenty))), by=ID]
#    ID V1
# 1:  1 10
# 2:  2  0
# 3:  3 10
# 4:  4 10

这只是试图在不重塑的情况下获得@eddi 的答案(我倾向于将其用作最后的手段)。

于 2016-06-01T22:43:35.467 回答
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您需要一个字典来将列名转换为相应的数字,然后它就相当简单了:

dict = data.table(name = c('none', 'ten', 'twenty'), number = c(0, 10, 20))

melt(dt, id.var = 'ID')[
  dict, on = c(variable = 'name')][, median(rep(number, value)), by = ID]
#   ID V1
#1:  1 10
#2:  2  0
#3:  3 10
#4:  4 10
于 2016-06-01T21:55:37.950 回答
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这是一种避免逐行操作和重塑的方法:

dt[, m := {
    cSD  = Reduce(`+`, .SD, accumulate=TRUE)
    k    = floor(cSD[[length(.SD)]]/2)

    m    = integer(.N)
    for(i in seq_along(cSD)) {
        left = m == 0L
        if(!any(left)) break
        m[left] = i * (cSD[[i]][left] >= k[left])
    }
    names(.SD)[m]
}, .SDcols=none:twenty]

这使

   ID none ten twenty    m
1:  1    0   3      0  ten
2:  2    5   2      2 none
3:  3    5   5      3  ten
4:  4    3   4      1  ten

对于循环,我借用@alexis_laz' 风格,例如https://stackoverflow.com/a/30513197/

我跳过了列名的翻译,但这很简单。你可以在最后使用c(0,10,20)而不是names(.SD)

于 2016-06-02T00:20:05.487 回答
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这是一种rowwise dplyr方法:

dt %>% rowwise %>% 
       do(med = median(c(rep(0, .$none), rep(10, .$ten), rep(20, .$twenty)))) %>%  
       as.data.frame
  med
1  10
2   0
3  10
4  10

受@Arun 回答的启发,这也有效:

dt %>% group_by(ID) %>% 
       summarise(med = median(rep(c(0, 10, 20), c(none, ten, twenty))))

Source: local data table [4 x 2]

     ID   med
  (dbl) (dbl)
1     1    10
2     2     0
3     3    10
4     4    10
于 2016-06-01T21:57:48.910 回答