r - cca 使用 vegan : 没有不受约束的惯性

Question

我使用 7500 个站点、9 个物种和 5 个约束变量的 vegan 进行 CCA 分析。结果是 >

Call: cca(sitspe = Yp, sitenv = Xp)

            Inertia Proportion Rank
Total                              
Constrained  0.5051               6
Inertia is mean squared contingency coefficient 

Eigenvalues for constrained axes:
[1] 0.3317 0.1301 0.0328 0.0089 0.0014 0.0003

我不明白为什么没有不受约束或完全惯性？

Answer 1

可能您的受约束轴解释了一切，并且没有留下任何受约束的惯性。无约束排序（CCA 无约束）你得到了多少轴？

您的数据实际上是非正方形的：矩阵维度是 7500 乘以 9。只有九种，如果这些是相关的或多余的，您可以用您的约束来解释一切。