r - 通过 Knitr 管道 R 降价？

Question

我从这个问题中发现，您可以从这样的脚本中调用Knitr ：

Rscript -e "library(knitr); knit('myfile.Rmd')

但是有没有办法让它使用标准输入和标准输出而不是文件？

我尝试了几种变化

Rscript -e 'library(knitr); knit2html(text=readLines(), output=stdout())'

但到目前为止还没有一个工作。

编辑：我想最坏的情况，我可以编写一个包装脚本，将标准输入写入临时文件，在其上调用 knitr，回显输出文件，然后删除它们。但这有点难看:(

Answer 1

好的，我今天又试了一次，这是一个工作脚本：

#!/bin/bash

# Hacky version of what I thought should be doable like so:
# Rscript -e 'library(knitr); knit2html(text=readLines(), output=stdout())'
# Turns out you need tempfiles for some reason?

input="/tmp/input.Rmd"
output="/tmp/output.html"
rcode="library(knitr); knit2html(input=\"$input\", output=\"$output\")"

cat /dev/stdin > "$input"
Rscript -e "$rcode" &> /dev/null
cat "$output"

您输入 R markdown 并输出 HTML。忽略任何错误。

Answer 2

这是一个版本：

#!/bin/Rscript
library(knitr)
input <- readLines('stdin')
invisible(knit(text=input, output=stdout(), quiet=TRUE))

然后（假设脚本是knit.R，rmd 文件是test.R和 md 到 html 转换是multimarkdown：

knit.R < test.Rmd | multimarkdown > test.html