问题标签 [neuro-image]
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python - 神经影像学“nipype”插件不起作用
我正在做一些事情,这实际上是我的第一次,所以事情对我来说还不是很清楚,我运行了这个代码:
这是我运行最后一行代码时显示的错误:
还有一个问题:当我尝试运行此代码时:
这是显示的错误消息:
如果有人知道解决方案,请帮助我。顺便说一句,我从视频系列中这样做,这是链接:https ://www.youtube.com/watch?v=4FVGn8vodkc&t= 4414s Nipype 展示部分。
python - 如何减少 MRI(.nii 格式)图像中的通道数?
我一直在尝试将大脑 MRI 图像数据集(IXI 数据集)提供给 ConvNet,但是,有些图像有 140 个通道,而另一些有 150 个通道。如何使所有图像具有相同数量的通道,这样我就不会遇到固定 CNN 输入形状的问题?我正在使用 nibabel lib 来读取 .nii 文件。
编辑:我对 MRI 图像了解不多,应该丢弃哪些通道?
python - 如何将 3D nii gz 图像阵列重塑为 2D?
我有很多 nii.gz 图像需要从 3D 重塑为 2D,我正在尝试使用以下代码,但由于 nii.gz 扩展名,它无法正常工作:
谁能帮我?
这是我正在使用的图像类型的示例:https ://drive.google.com/drive/folders/1681T99hp6qZRUgx1Ej_h1hwFv1g_LJo4?usp=sharing
python - 使用 nltools 的 Brain_Data() 时出现 ImageFileError
我对神经影像学过程非常陌生,并尝试使用 nltools 加载神经影像学数据。因此数据集可以在以下位置找到:https ://gin.g-node.org/ljchang/Localizer
我已将其下载到本地,这是我访问.nli.gz
文件的代码
然而, Brain_Data() 提高
我确定路径正确并且文件具有完全控制权限。太感谢了!
r - 使用 R 创建 10-20 蒙太奇(EEG,fNIRS)图
我一直在浏览互联网,试图找到一种可重现的方法,从 R 中的 EEG 和 fNIRS 出版物中创建 10-20 个蒙太奇图(您经常在文章中看到)。一个例子是
许多创建漂亮图形的软件包都是基于 MRI 的(brainconn,threeBrain),但这些似乎不允许根据 10-20 空间标记电极。
如果有人有任何建议或意见,将不胜感激。